解析対象とされる複数の変数のどれか一つでも欠損値を持つケースを計算から除外すること。従って，欠損値が多いデータは解析に使用できる有効ケース数が少なくなるという欠点がある。相関係数行列を求める場合にはリストワイズ除去とペアワイズ除去のいずれを行うか選択できる。

ペアワイズ除去も参照のこと。