「統計学関連なんでもあり」の過去ログ--- 045

No.16721　Coxの比例ハザードモデル　　【赤岳】　2012/04/05(Thu) 00:31

最近R（Ver2.14.2）をインストールし，使い方については，このHPや，WEB，説明本などで学習しているところです。
さて，統計学自習ノートの生存率解析の中に，Coxの比例ハザードモデルの項がございますが，ここでは，Logrank検定の項のようにRによる解析のプログラムが見つかりません。
また，青木先生の著書の「Rによる統計解析」の中でも記述が見つかりません。
Treatment(A,B)として，それぞれにTime to eventがあり，共変量として，Age，重症度，性などがある場合，どのようにプログラムすればよろしいのでしょうか。
あるいは参考となる資料があればご教示いただければと思います。
なお，RによるSurvival関連の解析は，基本のパッケージではなく，別のパッケージをインストールする必要があるのかなと思っていますが，それをインストールする方法がよくわかりません。
基本的な質問で大変恐縮いたしますが，ご教示よろしくお願いします。

No.16722　Re: Coxの比例ハザードモデル　　【青木繁伸】　2012/04/05(Thu) 08:48

survival パッケージが必要です。パッケージのインストールは，メニューバーから選択します。Mac なら「パッケージとデータ」==>「パッケージインストーラ」，Windows なら「パッケージ」==>「パッケージのインストール」

インストール後，以下のようにやってみてください

library(survival)
? coxph
example(coxph)

http://www1.doshisha.ac.jp/~mjin/R/37/37.html なども参考になるでしょう。

No.16726　Re: Coxの比例ハザードモデル　　【赤岳】　2012/04/05(Thu) 16:35

青木先生
インストールできました。
また，COX回帰モデルのサンプルで確かに作動しました。
ご教示，ありがとうございました。